Lintopdrachten overslaan
Verdergaan naar hoofdinhoud
VersiegeschiedenisVersiegeschiedenis

Type test

WGS - MultiLocus Sequence Typing (WGS-MLST)

Info

1. Beschrijving van de test:
Moleculaire typering van enterokokken via whole genome sequencing (WGS) van enterokokken. Op basis van de bekomen sequenties wordt het MLST-type bepaald.
Typering in de diepte gebeurt aan de hand van het core genome in combinatie met epidemiologische data.
 
2. Doel van test WGS
Bepalen van het sequentie-type en clonale verwantschap
 
3. Criteria voor het uitvoeren van deze test
Zie identificatie enterokokken
Meer dan 1 stam moet beschikbaar zijn en vermoeden van een uitbraak, enkel na contact met referentiecentrum (refererntiecentrum@uza.be).
 
4. Geschikte monsters
Reinkweek op plaat met individuele kolonies
 
5. Instructies voor transport
Zie identificatie enterokokken
 
6. Onaanvaardbare aanvragen
  • Geen reinkweek
  • Onvolledig aanvraagformulier
7. Turn around time en analysefrekwentie:
Analysefrekwentie: Per volledige run tenzij uitbraak (contacteer het NRC indien uitbraak)
Turn around time: contacteer het referentiecentrum
 
8. Rapportering van testresultaten

Hoe: via fax

Wanneer: als volledig analyseresultaat gekend is

nr

5

Bijlagen

Inhoudstype: Item
Versie: 6.0
Gemaakt om 25-10-2016 16:11 door Muyldermans, Gaetan
Laatst gewijzigd op 15-9-2021 12:07 door Klamer, Sofieke